Обычно это происходит, когда админу на домашний комп подсаживают троян, который он не видит, и этот троян постоянно сливает пароль от фтп злоумышленникам, и они вставляют вредоносный код. Либо если пользоваться скачанным фтп-клиентом непонятно откуда, с кряком и т.д., там почти всегда будет троян, который сливает пароли. Надо пользоваться только фтп программами с официальных сайтов